道路过江通道：南京长江大桥（道路）、大胜关长江大桥（南京长江三桥）、江心洲长江大桥（南京长江五桥）、定淮门长江隧道、应天大街长江隧道等。

铁路及轨道过江通道：南京长江大桥（铁路）、大胜关铁路大桥、轨道3号线、轨道10号线、轨道S3号线等。

京沪高铁、宁杭城际铁路、宁安城际铁路、沪汉蓉铁路、沪宁、宁芜等铁路干线交汇，周边有高铁南京南站、南京站、南京北站等铁路站点，是全国高铁网的重要枢纽。乘高铁至北京仅需3小时，至上海、杭州仅需1小时，未来将有8-10条线，直达全国省会城市。

南京禄口国际机场是中国十大机场之一，也是中国第五大国际货运机场，260条航线覆盖全国、辐射亚洲、连接欧美，国际直航线路已覆盖11个“一带一路”沿线国家，机场距离开发区仅40分钟车程。

周边通往国内主要城市的高速公路有：G42沪蓉高速（沪宁高速、宁合高速）、G36宁洛高速、G40沪陕高速（宁连高速）、G25长深高速（宁杭高速）、G328宁通高速等。国道有：312国道（上海-新疆）、205国道（秦皇岛-深圳）、104国道（北京-福州）、328国道（南通-南京）等。

除长江内贸航线外，已开通南京港一上海港外贸内支线直航航线，七坝港到上海洋山港仅需33小时，计划每周开航5班。